Si vous vous réveillez un matin avec de la fièvre, un essoufflement et une toux - en d'autres termes, des symptômes du nouveau coronavirus - vous vous demanderez probablement comment vous pouvez vous faire dépister et ce que cela implique.
Si vous êtes aux États-Unis, il est probable qu'un professionnel de la santé utilisera un long Q-tip pour tamponner le fond de votre gorge, puis enverra cet échantillon pour analyse. Si vous vous trouvez dans un pays qui a développé un test de détection d'anticorps, comme la Chine, vous risquez de vous faire prélever du sang.
Ce qui se passe à côté de ces échantillons est très différent. Le prélèvement de gorge est bien adapté pour les tests de réaction en chaîne par polymérase, également connus sous le nom de PCR, tandis que l'échantillon de sang sera extrait pour les anticorps spécifiques à la nouvelle maladie, connue sous le nom de COVID-19.
Les deux tests ne prennent que quelques heures à exécuter, ce qui signifie que les résultats pourraient être prêts en une journée, a déclaré le Dr Amesh Adalja, spécialiste des maladies infectieuses et chercheur principal au Johns Hopkins Center for Health Security à Baltimore. Cependant, une fois la forme rapide de ces tests de PCR et d'anticorps créée, les résultats pourraient être prêts en moins d'une heure, a-t-il déclaré.
"Il existe des tests PCR rapides, mais ils ne sont pas encore tout à fait disponibles" pour le nouveau coronavirus aux États-Unis, a déclaré Adalja à Live Science.
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Les tests COVID-19 développés par les Centers for Protection and Disease Control (CDC), ainsi que ceux développés à Washington et à New York, sont des tests PCR.
Les tests PCR fonctionnent en détectant du matériel génétique spécifique dans le virus. Selon le type de PCR disponible, les agents de santé peuvent tamponner le fond de la gorge; prélever un échantillon de salive; prélever un échantillon liquide des voies respiratoires inférieures; ou sécuriser un échantillon de selles.
Une fois qu'un échantillon arrive au laboratoire, les chercheurs extraient son acide nucléique, qui détient le génome du virus. Ensuite, les chercheurs peuvent amplifier certaines régions du génome en utilisant une technique connue sous le nom de réaction de polymérisation en chaîne par transcription inverse. En effet, cela donne aux chercheurs un grand échantillon qu'ils peuvent ensuite comparer au nouveau coronavirus, appelé SARS-CoV-2.
Le SRAS-CoV-2 compte près de 30 000 nucléotides, les éléments constitutifs de l'ADN et de l'ARN. Le test PCR développé par l'Université de Washington School of Medicine (UW Medicine) cible seulement 100 nucléotides spécifiques au SARS-CoV-2, le Dr Alex Greninger, professeur adjoint au Département de médecine de laboratoire et directeur adjoint du Laboratoire de virologie clinique à UW Medicine, a déclaré au Seattle Times.
Ces 100 nucléotides comprennent deux gènes dans le génome du SRAS-CoV-2. Un échantillon est considéré comme positif si le test trouve les deux gènes, non concluant si un seul gène est trouvé et négatif si aucun gène n'est détecté.
Les tests de UW Medicine qui ne sont pas concluants ou positifs sont envoyés aux laboratoires de santé publique de Washington et au CDC pour des tests supplémentaires, a rapporté le Seattle Times.
En revanche, les tests sérologiques recherchent des anticorps spécifiques que le corps a produits pour lutter contre le virus. "S'ils détectent ces anticorps, cela donne un résultat positif", a déclaré Adalja. Singapour a développé un test expérimental d'anticorps pour COVID-19, a rapporté le magazine Science, et la Chine en a également autorisé plusieurs, selon STAT News.
Un test sérologique est avantageux car il peut détecter des anticorps même si un patient s'est rétabli, tandis qu'un test PCR ne peut détecter le virus que si la personne est actuellement malade. Cependant, les deux tests peuvent manquer des cas si les échantillons sont prélevés trop tôt, lorsque la charge virale est trop faible ou si le corps de la personne n'a pas encore produit d'anticorps contre le virus, a déclaré Adalja.
Pour le test sérologique, cela peut prendre environ une semaine avant que le corps produise de nombreux anticorps, bien que "à mesure que nous obtiendrons plus de tests sérologiques, il y aura des indications sur les délais nécessaires pour effectuer un test sérologique", a déclaré Adalja.
